Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms