Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc141E9Q8Q6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc141E9Q8Q6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms