Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430078G23RikE9Q7Y4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430078G23RikE9Q7Y4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms