Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm5407E9Q7Q1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm5407E9Q7Q1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm5407E9Q7Q1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm5407E9Q7Q1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5407E9Q7Q1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5407E9Q7Q1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5407E9Q7Q1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms