Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdhr2E9Q7P9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdhr2E9Q7P9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdhr2E9Q7P9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdhr2E9Q7P9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdhr2E9Q7P9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms