Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Arhgef5E9Q7D5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms