Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Simc1E9Q6E9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms