Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20518E9Q548 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms