Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
8030474K03RikE9Q4Y8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms