Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms