Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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