Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms