Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd2E9PZM4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms