Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph10bE9PYQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms