Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms