Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30dE9PWL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms