Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc144bE9PVZ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms