Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6904E9PVF1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms