Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga1E1U8D0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms