Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21560D3Z7A4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms