Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms