Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf217D3YYI7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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