Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7849D3YX03 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms