Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim30cD3YVI9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30cD3YVI9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms