Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms