Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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