Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms