Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Abcc8B2RUS7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc8B2RUS7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms