Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms