Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms