Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf518bB2RRE4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms