Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc2B2RR83 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms