Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf3B2KF05 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms