Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H60cB1B213 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H60cB1B213 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms