Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plcb2A3KGF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plcb2A3KGF7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms