Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatsperbA2RTF1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms