Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtf1A2AQ19 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms