Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms