Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms