Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700003F12RikA2AKE5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700003F12RikA2AKE5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms