Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VirmaA2AIV2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VirmaA2AIV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms