Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms