Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms