Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc25a53A2AF28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc25a53A2AF28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms