Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb4A2A863 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms