Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap1-3A2A588 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms