Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms