Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms