Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms