Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms